Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACKR4Q9NPB9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms