Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG7

GBA2, Non-lysosomal glucosylceramidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBA2Q9HCG7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBA2Q9HCG7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBA2Q9HCG7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms