Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms