Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00597Q9H2U6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00597Q9H2U6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms