Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF39Q9H2S5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF39Q9H2S5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms