Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD4Q9H223 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms