Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED28Q9H204 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MED28Q9H204 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms