Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD1Q9GZZ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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HOXD1Q9GZZ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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HOXD1Q9GZZ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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HOXD1Q9GZZ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD1Q9GZZ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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