Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM39BQ9GZU3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms