Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms