Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms