Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP3Q9BWW4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms