Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD1Q9BUP0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFHD1Q9BUP0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms