Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms