Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF25Q9BQ70 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF25Q9BQ70 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms