Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP9Q99956 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms