Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYD88Q99836 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms