Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP8Q99708 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms