Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD5Q99666 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD5Q99666 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD5Q99666 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD5Q99666 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD5Q99666 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD5Q99666 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD5Q99666 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms