Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF3CQ99613 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3CQ99613 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms