Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCF12Q99081 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms