Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIN3AQ96ST3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms