Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMG1Q96Q15 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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