Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAPPC9Q96Q05 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms