Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSPG4P5Q96PW8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPG4P5Q96PW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms