Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF48Q96MX3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF48Q96MX3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms