Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKNOX2Q96KN3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms