Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM12Q96EX1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms