Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTERF3Q96E29 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTERF3Q96E29 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms