Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPRTQ96BW1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms