Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC8Q96B26 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC8Q96B26 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms