Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEF4Q8WZA2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms