Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CTTNBP2Q8WZ74 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms