Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms