Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP133Q8WUM0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP133Q8WUM0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms