Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDI1Q8WTU0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDI1Q8WTU0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms