Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3IP1Q8TDR0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms