Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE22Q8NFJ8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE22Q8NFJ8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms