Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLIS3Q8NEA6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLIS3Q8NEA6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLIS3Q8NEA6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GLIS3Q8NEA6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLIS3Q8NEA6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIS3Q8NEA6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms