Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC197Q8NCU1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC197Q8NCU1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms