Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM35BQ8NCS4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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