Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM229BQ8NBD8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM229BQ8NBD8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms