Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L2Q8NAA4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms