Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms