Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00469Q8N7U9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms