Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC2Q8N158 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms