Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LINC00518Q8N0U6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms