Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK4

COLGALT2, Procollagen galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT2Q8IYK4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT2Q8IYK4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT2Q8IYK4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT2Q8IYK4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT2Q8IYK4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT2Q8IYK4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT2Q8IYK4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT2Q8IYK4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms