Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC65Q8IXS2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms