Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC50Q8IVM0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms